云南省环境科学研究院加强科研项目立项申报工作，从多渠道争取资金开展环境保护科学研究，2014年2月成功申请了3个中国清洁发展机制基金赠款项目，即：《云南省二氧化碳排放峰值和减排路线图》、《昆明市低碳城市试点项目》和《云南省山地气候灾害风险管理和综合防御方案》，科研经费总额500万元。
云南省环境科学研究院从2012年截止目前申请到了6个中国清洁发展机制基金赠款项目，合同总金额达1200万元，是国内成功申请该类项目个数最多、合同金额最高的少数几个机构之一。目前也是云南省低碳和气候变化领域技术力量最强的机构，工作受到了国家发改委和省发改委的一致肯定。
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